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起源:丈夫雇人抢走儿子 清华女博士喊话作

起源:丈夫雇人抢走儿子 清华女博士喊话作者: 许尚达:

生物圈震撼:00后幼哥在客厅实现基因组测序,27亿美金壁垒塌了!

新智元报路

编纂:Aeneas

【新智元导读】一台U盘大幼的测序仪、几个AI模型——00后幼哥Seth Howes,就这样在自家客厅里实现了基因组测序,单独破解了家族几十年未解的自身免疫疾病之谜。在2023年,实现一次人类全基因组测序的成本是27亿美元,而他只花了1100美元!

就在今天,全网都被这位00后幼哥的故事刷屏了!

这位名叫Seth Howes的网友,利用便携式测序仪和Claude,在自家客厅就独立实现了齐全的基因组测序,并且成功追忆到家族多代自身免疫疾病的致病机造。

这些问题,已经令无数临床医生束手无策。

这些机造,此前没有任何一位临床医生能给出诠释?戳耸改甑牟,换了无数家医院,答案最后是在自己客厅里找到的。

这个尝试太震撼,生物技术圈此刻已经炸锅了!

Claude大模型,竟然让基因测序从本钱密集型活动造成幼我工具。

生物学钻研的地址不再是哪家顶级尝试室的昂贵机台,也不是什么医学院的公共平台,而是自家客厅!

桌子上的尝试室,蕴含加热?椤⑽行竦雌鳌⒚阅憷胄睦怼⒁埔浩鳌inION

此刻,这个帖子已经全网刷屏了。

在尝试室做了十年尝试的人都感伤:你真是太专业了。

做遗传学钻研的人都说,这个基因组测序项目正切合自己的钻研领域。

一位患有肿瘤的患者暗示,这个尝试切实是意思重大。

能够说,这是一个足以震撼整个生物圈的DIY实际:从此,生物学钻研突破了机构垄断,彻底进入幼我时期!

他但愿,从病痛中夺回性命决策权

Seth Howes是一名exolabs的前工程师,并且是牛津的医学博士,和帝国理工的机械进建博士。

Seth的钻研并非起于学术兴致,而是源于一份繁重的家族遗传压力。

他的家族持久面对高风险的自身免疫性疾病。

就在他进行尝试期间,他不到40岁的姐姐因病导致肝脏严重受损,在期待两年后才艰巨获得肝源进行手术。

「我并不空想能治愈家族的顽疾,但我的确想弄领略,为什么k8凯发天生赢家身段味一代又一代地反噬自身?」

正是这种对性命底层代码的好奇心,再加上对数据隐衷的钻营,促使他决定在客厅搭建起一个「数字药剂师」的工作台。

终于,在他看来,「你最私密的数据不应该脱离你的屋子」。

主题黑科技:AI的指数级加持

从前,全基因组测序是大型尝试室的专利,动辄耗资数十万美元。

而这次Seth的成功,关键在于三个身分的加持。

硬件:口袋里的「基因读取器」

首先,在硬件上,他使用的是Oxford Nanopore MinION测序仪。

这器材只有U盘大幼,插在电脑上就能读取DNA序列。

几年前,同样的事件必要一台占满整个房间的Illumina测序仪,配上一支专业团队和一笔六位数的预算。

而此刻,这个只有充电宝大幼的设备,内部布满了约2000个纳米孔(直径仅1纳米),当DNA片段穿过这些孔洞时,引起的微电流变动会被纪录下来并转化为遗传代码。

它将测序成本从数十万美元降到了1000美元级别,将来甚至可能降至100美元。

能够说,MinION把「读取DNA」这件事,从一个本钱密集型行为造成了一个工具型能力。

就像3D打印机把「造作」从工厂搬到了桌面,MinION把「测序」从尝试室搬到了客厅。

AI模型:从「读代码」到「理解职能」

但是在尝试中,光读出A、T、C、G四个碱基是不够的。

30亿个碱基对的原始数据摆在刻下,若是不知路它们意味着什么,就只是一堆字母。

这就是AI登场的处所。在尝试中,用到了两个关键模型。

第一个是Evo2。

这是Arc Institute开发的基因组基础模型,参数规模达到70亿,在全球超过12万个物种的基因组数据上训练。它能做的事件是:给一段DNA序列,预测这段序列在生物学上的职能。

你注定反映过来了——这就是一个生物学版的GPT!

GPT读懂人类说话,Evo2读懂性命说话。区别是,Evo2读的那本书有30亿个字母长。

第二个是AlphaGenome。

Google DeepMind出品,专门做基因组职能预测。它不只是通知你「这段DNA编码了什么蛋白质」,而是能预测「这个位点的突变会对基因表白和染色质结构产生什么影响」。

从「读DNA」到「理解DNA职能」,这个逾越,从前必要一整个分子生物学尝试室花几个月去验证。此刻,一个模型跑几个颖厩出了局。

接口简化:大模型成了「尝试室助理」

说到这儿,整件事里最让人意表的细节不是测序仪,也不是基因组模型,而是Claude。

Seth在操作过程中,用Claude天生了BED文件。

BED文件是基因组学的尺度数据体式,纪录基因组上特定区域的坐标信息。以前写这种文件必要懂生物信息学的专业人员手动编写,或者用专门的号令行工具。

此刻的做法是:用天然说话通知Claude「助我天生一个BED文件,覆盖这几个基因区域」,它就天生了。

生物学操作,已经被说话接口收受。

幼我尝试室时期来了

此刻,硬件布衣化(MinION)、AI理解力指数级提升(Evo2 + AlphaGenome)、操作门槛被说话接口抹平(Claude),直接组成了一个齐全的范式转移链条。

每一环单独拿出来都不算新闻。但三环同时关合,就出事了!

一个有好奇心的年轻人,在自家客厅解开了临床医生十几年都解不开的谜。

这件事的冲击力,不在于Seth幼我的故事有多传奇,而在于它揭示了一条在加快的曲线。

测序成本的降落轨迹,比摩尔定律还狠。

2003年,实现一次人类全基因组测序的成本是27亿美元。2007年降到1000万。2014年降到1000美元。2024年,部吩旖台已经能做到200美元以下。

下一个指标,是100美元。

这条曲线的斜率意味着,在不远的将来,测序你自己的基因组,成本可能比做一次全身段检还低。

好多人第一反映是:这不就是个极客的hobby project吗?通常人谁会在家测基因组?

但回顾一下,2010年的时辰,有几多人感触「通常人会在家里用3D打印机」?

每一次工具链关合之后,从极客玩具到公共利用的窗口期都在缩短。这一次的窗口期可能更短,由于背后的驱动力是刚需。

客厅尝试实录:若何在家「读」懂自己的DNA?

Seth颁布的齐全操作规程显示,他的尝试室设备除了精密移液器表,好多都来自eBay二手或速卖通。

在样本提取阶段,他没有采取复杂的抽血,而是用无菌口腔拭子摩擦面颊内侧,仅用 1根拭子就获得了约5-7微克 DNA,远超尝试所需的1微克。

自适应采样,就是MinION的杀手锏。

Seth通过软件节造,让测序仪在读取每个片段的前500个碱基时进杏赘初筛」:若是是他关切的免疫有关基因,就持续读;若是不是,就回转电压把DNA链「吐出来」,换下一条。

运行起头几分钟后,MinKNOW 节造面板上的纳米孔活性状态

这个过程中,他使用了M3 Ultra芯片的Mac Studio进行实时碱基鉴别,并利用英伟达的DGX Spark提升分析速度,保障了算力。

生物学,不再属于幼我垄断

1970年代,推算机还是大型机构的专属工具,而后幼我电脑出现了,而后互联网出现了。

生物学在走统一条路。

测序仪是幼我电脑,基因组基础模型是操作系统,Claude是用户界面。倒剽三层同时就绪,生物学的「幼我推算机时刻」就到了。

Seth在客厅里实现基因组测序的那个下午,可能就是这个时刻的第一帧画面。

十年后回头看,2026年或许是一个分水岭。

这场尝试的意思远不止于一个技术宅的成功。它标志取生物学钻研在经历一场从机构垄断向幼我DIY模式的范式转移。

当复杂的生物学操作被AI简化为说话对话,当昂贵的仪器造成人人可职守,通常人就能自动解析性命的底层逻辑。

正如Seth所说,他在摆弄基因回路使匾到了幼时辰摆弄电脑的快感,这种「极客心灵」在开启一个新的时期。

接下来,AI还会创造几多事业?

参考资料:

https://iwantosequencemygenomeathome.com/

https://x.com/ReyJudgementOS/status/2046201536683061374

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